人體感染賈第蟲后出現以腹瀉為主的吸收不良綜合征，腹瀉呈水樣糞便，量大、惡息、無膿血。兒童患者可由于腹瀉，引起貧血等營養不良，導致生長滯緩的疾病。若不及時治療，多發展為慢性，表現為周期性稀便，反復發作，大便甚臭，病程可長達數年。
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