中心成立于2005年12月，為正縣級財政全額預算管理衛生事業單位，建筑面積25000余平方米，設有泰山學者工作站和博士工作站各1處，現為山東大學、山東第一醫科大學、濟寧醫學院等高等院校的實踐教學基地。主要履行疾病預防與控制、突發公共衛生事件應急處置、疫情及健康相關因素信息管理、健康危害因素監測與干預、實驗室檢測檢驗與評價、健康教育與健康促進、技術管理與應用研究指導等基本職責。中心不僅承擔了全市疾病預防與控制的技術指導等業務工作，也在支援新疆、抗震救災、大型活動應急保障等方面發揮了重要作用。連續多年被評為省級文明單位，先后被授予全省抗擊新冠肺炎疫情先進集體、全省先進基層黨組織、全省衛生健康工作先進集體、全國五四紅旗團支部等榮譽稱號。